在妊娠早期进行亲子鉴定，常见的方法包括羊水穿刺、绒毛膜穿刺和无创胎儿DNA检测。具体如下：

1. 羊水穿刺：这是一种侵入性检查，需在B超引导下从孕妇腹部抽取一定量的羊水样本，用于胎儿染色体分析。虽然准确度较高，但存在流产及感染风险。

2. 绒毛膜穿刺：同样属于侵入性操作，需在B超指引下通过腹部针取少量胎儿绒毛组织进行分析，准确度高但也可能引发流产和感染。

3. 无创胎儿DNA检测：这是一种非侵入性检测手段，适用于怀孕6周后。通过对孕妇外周血中的游离胎儿DNA进行分析，虽准确性相对较低，但其安全性和微创性较强。

在进行孕期亲子鉴定时，根据亲鉴网的推荐，通常需要准备以下材料：

1. 身份证件：提交双方的身份证件，如孕妇的身份证明。

2. 样本采集：一般采取血液或尿液作为样本，由专业医护人员采集孕妇的静脉血或者获取胎儿的绒毛、羊水等样品。

3. 样本检验：收集样本后，医生将对样本进行全面检验并复核，以确保样本质量符合要求。

关于最佳鉴定时机，尽早进行鉴定是首选，因为每过一天都可能加剧等待结果的焦虑。然而，为了确保鉴定准确和安全，选择合适的时间也很关键。理论上，可在孕前晚期到分娩期间进行，但由于某些个体血液中胎儿DNA含量可能不足，导致提取困难，因此建议无创胎儿DNA检测的最佳时间为大约8周左右。对于侵入性产前鉴定，则需要更长的准备时间，并且在此期间也可能存在不确定性。

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